强基学院设三个党政机构、四个教学机构。中层领导4人、科级干部2人、教研室主任4人。同时,设有学生体质健康乐动在线(中国)有限公司官网室、数学建模乐动在线(中国)有限公司官网室、物理乐动在线(中国)有限公司官网室、语音室。